Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms