Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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