Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms