Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms