Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FAM19A4Q96LR4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms