Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms