Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms