Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms