Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMG8Q8ND04 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms