Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms