Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf39Q6ZRI6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms