Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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Atp8b3Q6UQ17 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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Atp8b3Q6UQ17 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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Atp8b3Q6UQ17 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b3Q6UQ17 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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