Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms