Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms