Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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