Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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