Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms