Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CAPSQ13938 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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