Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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