Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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