Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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