Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXO1Q12778 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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