Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms