Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms