Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms