Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TAC1-201ENST00000319273 1239 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LIPT1-201ENST00000393471 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL034428.1-201ENST00000425939 1101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NDUFB5-205ENST00000472629 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC093334.1-201ENST00000559904 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL138689.1-201ENST00000614612 668 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 FCER1A-202ENST00000368115 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RN7SKP42-201ENST00000410913 300 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC01686-201ENST00000566297 1376 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms