Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23BP54727 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms