Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL9P32969 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL9P32969 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms