Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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