Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VARSP26640 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VARSP26640 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VARSP26640 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VARSP26640 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VARSP26640 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VARSP26640 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms