Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL2P19875 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CXCL2P19875 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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