Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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