Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms