Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms