Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms