Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP36Q9P275 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP36Q9P275 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms