Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms