Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC4A5Q9BY07 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms