Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms