Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms