Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDRT15Q96T59 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms