Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms