Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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