Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD35Q8N283 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms