Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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