Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms