Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms