Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT3Q5FWE3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT3Q5FWE3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms