Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms