Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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